| Mandák B. & Sádlo J. 2006: Panicum capillare L. subsp. capillare, 1753 - proso vláskovité pravé. In: Mlíkovský J. & Stýblo P. (eds.) Nepůvodní druhy fauny a flóry České republiky. ČSOP, Praha., 136 - 136. |
| Mandák B. & Sádlo J. 2006: Setaria faberi F. Hermann, 1910 - bér ohnutý. In: Mlíkovský J. & Stýblo P. (eds.) Nepůvodní druhy fauny a flóry České republiky. ČSOP, Praha., 176 - 176. |
| Mandák B.& Sádlo. J 2006: Chenopodium botrys L., 1753 - merlík hroznový. In: Mlíkovský J. & Stýblo P. (eds.) Nepůvodní druhy fauny a flóry České republiky. ČSOP, Praha., 106 - 106. |
| Mandakova T. & Munzbergova Z 2006: Distribution and ecology of cytotypes of the Aster amellus aggregates in the Czech Republic. Annals of Botany 98, 845 - 856 . |
| Maršálek B., Bláha L., Babica P., Adamovský O., Kohoutek J., Bláhová L., Maršálková E., Sukačová K. & Feldmannová M. 2006: The system for complex monitoring of toxic cyanobacteria in the czech Republic reservoirs. In: BooK of abstract, Reservoir Limnology And Water Quality, ISBN 80-86188-23-X, 109 - 112. |
| Maršálek B., Drábková M., Maršálková E., Feldmannová M. & Jančula D. 2006: Omezení masového rozvoje plantkonních sinic: sumarizace metod. Cyanobakterie 2006. Botanický ústav AV ČR, Průhonice, 114 - 131. |
| Maršálek B. & Feldmannová M. 2006: Techniky pro ošetření sedimentů v nádržích. In: Maršálek B., Feldmannová M. & Maršálková E. (ed.) Sborník semináře Cyanobakterie 2006. Botanický ústav AV ČR, Průhonice, ČR (ISBN 80-86188-22-1), 139 - 143. |
| Maršálek B. & Gregor J. 2006: Přehled metod pro kvantifikaci biomasy planktonních cyanobakterií (sinic). In: Maršálek B., Feldmannová M., Maršálková E. (eds.) Cyanobakterie 2006 - biologie, toxikologie, management, 80 - 85. |
| Maršálek B., Hořanská L., Maršálková E. & Feldmanová M. 2006: Metody hodnocení účinnosti korekčních zásahů pro omezení masového rozvoje planktoních sinic. In: Maršálek B., Feldmanová M., Maršálková E. (Eds.) Cyanobakterie 2006, Brno, Česká republika, 96 - 98. |
| Maršálek B., Jedličková B., Feldmannová M., Jančula D., Maršálková E. & Drábková M. 2006: Databáze metod, technik a prostředků pro omezení masového rozvoje planktonních sinic. Maršálek B., Feldmannová M., Maršálková E. (ed.) Cyanobakterie 2006. Botanický ústav AV ČR, Průhonice, 165 - 167. |
| Maršálek B., Maršálková E. & Feldmannová M. 2006: Plánování korekčních zásahů pro omezení masového rozvoje planktonních sinic,. In: Maršálek B., Feldmannová M. & Maršálková E. (ed.) Sborník semináře Cyanobakterie 2006. Botanický ústav AV ČR, Průhonice, ČR (ISBN 80-86188-22-1), 161 - 164. |
| Maršálek B., Maršálková E. & Feldmannová M. 2006: Základní principy omezení masového rozvoje cyanobakterií. In: Maršálek B., Feldmannová M. & Maršálková E. (ed.) Sborník semináře Cyanobakterie 2006. Botanický ústav AV ČR, Průhonice, ČR (ISBN 80-86188-22-1), 111 - 113. |
| Maršálková E. & Maršálek B. 2006: Technologie pro odstraňování cyanotoxinů ve vodárenských procesech. In: Maršálek B., Feldmannová M. & Maršálková E. (ed.) Sborník semináře Cyanobakterie 2006. Botanický ústav AV ČR, Průhonice, ČR (ISBN 80-86188-22-1), 105 - 108. |
| Martínková J., Klimešová J. & Mihulka S. 2006: Vegetative regeneration of biennial Oenothera species after disturbance: field observations and experiment. Flora 201, 287 - 297. |
| Mertanová S., Smatanová J. et al. 2006: Zoznam taxónov zaznamenaných na Floristickom kurze Pruské 2003. Bulletin Slovenskej botanickej spoločnosti 28, 31 - 102. |
| Mihulka S., Pyšek P., Martínková J. & Jarošík V. 2006: Invasiveness of Oenothera congeners alien to Europe: Jack of all trades, master of invasion? Perspectives in Plant Ecology Evolution and Systematics 8, 83 - 96. |
| Mildén M., Münzbergová Z., Herben T. & Ehrlén J. 2006: Metapopulation dynamics of a perennial plant, Succisa pratensis, in an agricultural landscape. Ecological Modelling 199, 464 - 475. |
| Moravcová A., Nedbalová L., Lukavský J. & Rauch O. 2006: Diatom species composition in mountain streams under impact of anthropogenic pollution (Bohemian Forest, Giant Mountains). In: Ács É., Kiss K.T., Padisák J. & Szabó K.É. (eds.): 6th International Symposium Use of algae for Monitoring Rivers. Hungarian Algological Society., 95 - 95. |
| Moravcová L., Pyšek P., Pergl J., Perglová I. & Jarošík V. 2006: Seasonal pattern of germination and seed longevity in the invasive species Heracleum mantegazzianum. Preslia 78, 287 - 301. |
| Münzbergová Z. 2006: Effect of population size on prospect of species survival. Folia Geobotanica 41, 137 - 150. |